取出结石的方式主要有几种，通常根据结石大小决定：1、＜0.5cm结石：泌尿系结石50%可自行排出，通常若无较明显泌尿系畸形，此类结石临床中有90%可通过喝水、活动排出。但部分患者输尿管略微畸形，或是结石恰巧堵在较狭窄地方，这种情况几率较小；2、0.5-1cm结石：剩下50%结石需通过医生干预取出，如体外碎石。体外碎石方法，对于直径＜1cm的结石效果较好。通常1-2次体外碎石便能将结石变小，然后排出；3、1-2cm结石：若结石大小在1cm以上，位置较差，可通过输尿管镜手术，将结石打碎后取出。通常控制在2cm以下，但也可通过多次输尿管镜，来取更大、或更多的结石；4、＞2cm结石：对于此类结石，可采取经皮肾镜等方法进行取石；5、结石伴合并症：对于伴有合并症或是有严重输尿管狭窄、肾盂畸形的病人，万不得已时，还可采取手术方法。手术方法包括腹腔镜手术、开放性手术地等，现仅占到现代泌尿外科的5%不到。