胃肠道间质瘤伊马替尼治疗耐药，这是临床上非常常见的一个问题，分为原发性耐药和继发性耐药，耐药后的治疗模式也不完全相同，具体如下：1、原发性耐药：一般来讲，大多数患者是在一线伊马替尼治疗以后半年之内就发生进展的，叫做原发性耐药，大概5%-6%的患者会出现。最大的可能性是因为基因类型是野生型，或者是PDGFRα18外显子突变，尤其是D842V突变。目前对于这部分患者来讲，阿伐替尼是专门针对PDGFRα18外显子D842V突变的新型药物，所以目前来讲，阿伐替尼是针对PDGFRα18外显子D842V突变的首选治疗；2、继发性耐药：伊马替尼治疗，还有一种叫做继发性耐药，也就是说患者在口服伊马替尼治疗肿瘤缓解或者稳定很长时间之后，出现肿瘤的再次进展，目前来讲把这种患者都叫做伊马替尼的继发性耐药。80%以上的患者在使用伊马替尼以后有可能会发生继发性耐药，对于这部分患者来讲，后续治疗需要做一个全面评估，即是否有手术机会，如果不能手术，就需要根据患者再次活检的基因突变类型换用药物，比如可以换用二线的舒尼替尼、瑞戈非尼，但是这两个药物的副作用比较大，而且对于肿瘤的退缩临床数据比较少，索性现在有一些新的药物出现，尤其是瑞派替尼对绝大多数突变类型的晚期胃肠道间质瘤都有效。当然指南当中也推荐伊马替尼耐药，如果患者有手术的潜在切除的可能性，就需要做一个更激进的治疗，有可能会把瑞派替尼作为二线治疗，让肿瘤退缩之后争取做到R0切除，让患者有更长的生存期。