青春期发育延迟除简单的问诊、查体之外，还需做相应的实验室检查。如拍骨龄片，还有男孩需进行性激素水平检查、睾丸超声检查，女孩检查子宫及附件的超声检查；还有染色体检查，如果男孩也有体表特征，面容面容相对特别幼稚，并且外生殖器发育非常落后，也可以查染色体，因为有的男孩Y染色体发育有问题，也会造成青春期发育延迟；共同需要进行的检查是血生化检查，评估钠、钾、钙等电解质的代谢有无问题。一般遗传代谢性疾病均有血生化的改变，也可表现出青春期发育落后、延迟；如青春期发育延迟伴随身材发育落后，可进一步查脑垂体的核磁及对性激素有协同作用的甲状腺激素、肾上腺激素等。所以，进行青春期发育延迟的鉴别诊断，其辅助检查较多且有必要。