幽门螺杆菌分为有创性检查和无创性检查。有创性检查属于侵入性检查，通过胃镜检查，取胃黏膜组织进行检测，比如快速尿素酶试验，胃黏膜直接涂片染色镜检，胃黏膜组织切片染色镜检、细菌培养、基因芯片方法检测。无创性检测属于非侵入性检测，不用做胃镜，比如碳13或碳14尿素呼气试验、粪便幽门螺杆菌抗原检测、血清幽门螺杆菌抗体检测。其中，血清抗体检测反映的是一段时间内的幽门螺杆菌感染情况，幽门螺杆菌根除后，血清抗体可以维持数月到数年，因此不能用于治疗幽门螺杆菌之后的复查。目前大多数医院开展的检测项目是碳13或碳14尿素呼气试验，这种检测方法准确性高，易于操作，可以反映全胃幽门螺杆菌感染状况，敏感性和特异性高，而且还不需要做胃镜检查。