两个鼻孔交替性出现鼻塞的主要原因是鼻炎，特别为慢性鼻炎，主要症状为鼻堵、流鼻涕、打喷嚏、嗅觉下降以及头痛等症状。慢性鼻炎分为慢性单纯性鼻炎以及慢性肥厚性鼻炎，具体内容如下：1、慢性单纯性鼻炎：主要表现为交替性鼻塞，即两侧鼻孔轮流不通气，如果侧卧时下面鼻孔出现鼻塞现象，称之为交替性鼻堵，为典型的单纯性鼻炎表现。其主要治疗办法为局部使用鼻喷激素以及减充血剂，也可以使用中成药物口服治疗鼻炎，同时建议使用生理盐水或者生理海水冲洗鼻腔，则可减轻炎症症状，改善鼻堵以及鼻腔不通气症状；2、慢性肥厚性鼻炎：表现为持续性双侧鼻堵，其主要治疗方法为使用药物减充血剂以及鼻喷激素治疗，当药物治疗无效的情况下，采取手术切除下鼻甲以及低温等离子射频消融。