细菌性角膜炎和病毒性角膜炎的区别有： 1、从感染的微生物学的角度，顾名思义细菌性角膜炎感染的微生物是细菌，病毒性角膜炎感染的是病毒。鉴别可以进行微生物学的检验，如细菌性角膜炎可以对病灶取材以后进行微生物学的培养、细菌培养，可以鉴别是哪种菌，同时可以做药敏试验然后针对感染的菌种进行相应的敏感药物治疗。病毒性角膜炎理论上可以取材，通过检测病毒的DNA来明确是不是病毒，但是一般病毒性角膜炎都不进行微生物学的检查。病毒性角膜炎的诊断依据是患者的病史，还有角膜病灶的特征来进行诊断； 2、病毒性角膜炎和细菌性角膜炎，从病程上两者的不同点是病毒性角膜炎病程长，而且它典型的特点是容易反复发作，有的时候一年能够复发好几次，往往出现在患者疲劳或者感冒抵抗力下降情况下，病毒性角膜炎就会复发，但细菌性角膜炎通过药物治疗或手术治疗，一旦被控制，细菌被清除，不存在以后再复发的情况； 3、两者病人的症状上也不一致，病毒性角膜炎刺激症状、疼痛的感觉不会很重，但是细菌性角膜炎患者往往有很严重的眼疼、畏光、流泪明显的刺激症状。