牙窟窿里长肉，根据不同原因选择不同的治疗办法，具体情况如下：1、牙髓息肉：龋齿的龋洞中长出息肉样改变，通常是牙髓中的牙髓息肉，此时通常应该由牙体牙髓科医生进行标准的牙体治疗，方可起到较好的治疗效果；2、牙周组织息肉样改变：如牙龈炎、牙周炎导致息肉状改变，此时需在标准的牙周治疗基础上选择必要的外科手术，进行牙周息肉切除，才能起到较好的治疗效果；3、牙龈瘤增生样改变：需要选用个性化治疗方案，如外科手术切除，同时需警惕牙龈良性或恶性肿瘤；4、颌骨内囊肿或肿瘤样病变：侵犯牙龈后也可出现牙龈上肿物，患者会误认为是牙上长的增生物，需由专科医生制定个性化治疗方案，方可取得较好的治疗效果。