怀孕初期发现卵巢囊肿的严重程度和囊肿性质有关。由于整个孕期体内的孕激素分泌升高，有可能出现黄体生理性囊肿及黄体囊肿，特别是怀孕早期时，卵巢代偿可能增大出现黄体囊肿，一般黄体囊肿在孕3个月后可能自行消失，对整个怀孕影响不大。 如果病理性囊肿，必须明确囊肿的性质，对于小于5cm的良性囊肿可以定期复查，继续妊娠。对于恶性囊肿或较大囊肿，为防止病变进一步发展或囊肿破裂、蒂扭转，一般才需要手术治疗。手术时间在孕3个月后，这时胎盘功能已经开始健全，可以避免流产。随着微创技术的发展，良性卵巢囊肿可以选择腹腔镜下卵巢囊肿剥除术，如果囊肿存在恶变的可能，必要时必须终止妊娠。