咳嗽肩膀痛首先要分析咳嗽和肩膀痛之间的关系，具体情况如下：1、如果咳嗽在先，后来出现肩膀痛，此时需要考虑是否是咳嗽造成肩部周围肌肉的损伤，进而出现的肩膀痛；2、部分病人肩膀本身就存在原发疾病，如肩周炎或者存在部分骨折、肌肉损伤的问题，此时咳嗽动作本身也会加重病人的不适感觉，进而使疼痛加重；3、部分病人可能由于肺部炎症的相应部位恰好在肩膀附近，此情况也可能会反射影响到肩膀痛的问题。特别是炎症影响到胸膜，初步出现部分胸膜病变，部分病人可以反射性的出现肩膀痛的问题。同时对于胸膜的反应来讲，如果炎症到一定程度，胸水出现以后，此时疼痛症状会得到一定明显的缓解。对于判断疼痛的原因来讲，影像学检查也非常重要，部分病人肩膀痛是由于骨折或局部损伤所造成，此情况可以通过检查和配合影像学检查来判断。而至于肺脏本身病变或者胸膜病变所造成的影响，也可以通过一些特殊检查来判断。此外，疼痛时间也是一个非常重要的因素，如果疼痛呈一过性，通常也不需要特殊处理。而如果疼痛持续存在或者阵发性加剧，则需要到医院进行系统检查，针对其病因进行处理。