耳朵霉菌感染通常难以自愈，感染出现症状时说明持续时间较久或症状较重，已经超过自愈期才会出现自我感觉不适。当症状比较轻时，注意避免挖耳朵、耳道进水等情况，有可能逐渐恢复。若不能自行恢复，可以适当使用抗霉菌滴耳液，如克霉唑滴耳液或酮康唑软膏局部涂抹外耳道，可以获得较好疗效。当治疗效果不佳时，医生用吸引器将耳道分泌物以及霉菌吸引清理干净，再继续用药，必要时可以做细菌或霉菌培养，根据药物敏感试验进一步选择药物治疗。