免疫系统紊乱应积极进行治疗，可以用免疫抑制剂或者调节剂，将免疫系统功能降低，或将对身体有攻击性的免疫物质水平降低，再让免疫系统逐渐自行恢复。可应用糖皮质激素，如地塞米松、甲基泼尼松龙等，糖皮质激素按照作用半衰期而言，半衰期越长，抑制免疫、抗炎作用也越强。此外雷公藤多甙也有抑制免疫作用，含有冬虫夏草成分的百令胶囊，对免疫系统系统也有比较温和的调节作用。临床上免疫系统紊乱会累及肾脏、甲状腺等器官，导致产生较多疾病，建议患者最好到专科医院进一步治疗。