儿童错(牙合)畸形并非全部都是由于遗传所引起。总体上讲，错合畸形的病因可以分为遗传性和环境因素两大类。遗传因素主要是来源于种族的演化和双亲遗传两个方面。在人类的进化过程中，随着食物的选择由生变熟和细软，相对咀嚼功能则逐渐减弱，致使口腔器官亦会逐渐退化。其中(牙合)骨退化速度相对要快于牙齿，导致牙量大于骨量，出现牙齿拥挤等错(牙合)情况，双亲的牙(牙合)畸形可以遗传给下代子女。对于环境方面可以分为先天因素和后天因素，比如人工哺乳的奶瓶位置以及喂养姿势的不正确，儿童食物过于细软。且包括吐舌、吮指、咬下唇、口呼吸和偏侧咀嚼等不良习惯。另外对于替牙期间的乳牙早失、滞留、邻面龋坏以及多生牙和先天缺失牙等均可以引起错(牙合)畸形。根据统计，目前国内错(牙合)畸形的遗传因素约占错(牙合)畸形病因的30%，常见的因为遗传因素所致的错(牙合)畸形主要包括颜面不对称、牙列间隙、压力拥挤、牙齿数目形态及萌出时间的异常，或者下颌前突、上颌前突、下颌后缩和深覆(牙合)等。