脑干损伤会影响到瞳孔，主要影响瞳孔大小和瞳孔对光反射。眼球的运动和瞳孔的调节受动眼神经、滑车神经和外展神经控制，这些神经的神经核都位于脑干部位，所以相应的神经核受到损伤，瞳孔会出现相应的变化。脑干是由中脑、脑桥和延髓三部分组成，三者受到损伤，瞳孔会出现以下变化：1、脑桥部分出现损伤：瞳孔会呈现针尖样瞳孔，同时会有对光反射消失的现象；2、中脑部位出现损伤：单侧中脑受到损伤，一般刚开始表现为两侧瞳孔不等大，一侧瞳孔散大而对侧正常，同时对光反射消失，患者的两个眼球会向下、向外斜视。如果双侧中脑都受到损伤，可以表现为双侧瞳孔散大、眼球固定；3、如果脑桥外侧、延髓，以及颈髓腹侧受到损伤：可以出现霍纳综合征，表现为同侧瞳孔缩小、上眼睑下垂、瞳侧面部无汗的症状。