不健康的胚胎在多久会流产这个问题，首先需要了解引起胚胎发育异常的病因因素。通常情况下，由于染色体异常导致的胚胎发育异常往往会在妊娠的2个月内，也就是6-8周时发生自然流产；如果是感染因素或者理化因素导致的胚胎发育异常，则取决于致病因素在胚胎发育的哪个阶段发生。因此，一般来说，不健康或发育不良的胚胎通常会在妊娠的早期阶段，即6-8周甚至更早时发生流产。然而，并不是所有异常的胚胎都会在妊娠早期自然流产，个别胚胎在停止发育后可能会在子宫内长时间存留，这被称为稽留流产或胎停育，出现这种情况需要及时诊断，并进行清宫手术，因为停止发育的胚胎如果在子宫内滞留时间过长，会导致感染和母体凝血功能障碍等异常病理情况。总体而言，不健康的胚胎通常会在6-8周甚至更早时发生自然流产。