头顶出现针扎样阵疼，通常是头皮神经疼，原因主要是病毒感染，具体如下：1、单纯疱疹病毒感染：如儿童时期的感冒、嘴部疱疹等，通常为单纯疱疹病毒感染。单纯疱疹病毒一旦感染后，可以潜伏于神经根的部位，当身体抵抗力下降时，病毒进行复制，即出现相关症状。所以患者常感觉到神经性疼痛的发作，常见于身体状态欠佳时，如感冒着凉；2、带状疱疹病毒感染：通常带状疱疹病毒的毒性较强，可能疼痛1周左右，并且程度较重，还可见皮肤出现疱疹，可能表现为烧灼感。通常需要服用抗病毒药物进行治疗，可以选择阿昔洛韦、泛昔洛韦或者溴夫定等药物。针对神经疼痛，还可以选用卡马西平、加巴喷丁、普瑞巴林等抗癫痫的药物进行治疗。