深呼吸时咳嗽通常是由于吸入外界空气造成对气道的刺激，从而引起咳嗽，这种咳嗽通常与气道高反应相关。引起气道高反应的疾病通常是气道有炎症，一般是以嗜酸粒细胞浸润为主的炎症，很有可能是与过敏相关的疾病，与过敏相关的疾病最常见的是咳嗽变异性哮喘。咳嗽变异性哮喘是一种特殊类型的哮喘，咳嗽特点就是阵发性干咳，可以被外界因素所诱发，如吸入冷空气、花粉、灰尘等，而且在夜间和凌晨发作明显。除了咳嗽变异性哮喘，嗜酸粒细胞性支气管炎、变异性咳嗽，都可以出现由外界环境变化而带来的咳嗽，由外界刺激因素诱发咳嗽。到底是哪一个疾病还需要做相关检查才能进一步确诊，咳嗽变异性哮喘需要做气道激发试验来确诊，而嗜酸粒细胞性支气管炎需要做痰的细胞计数和分类进行确诊。