宫外孕保守治疗期间肚子会疼。肚子疼即腹痛，宫外孕患者在保守治疗的过程中会出现腹部或者下腹部隐痛、坠痛，有时持续时间较长。其原因是应用药物起到杀胚效果的同时也会有局部妊娠组织坏死，会出血，但是出血并不会特别严重，所以会局部形成凝血块，使得局部周围妊娠部位张力性增加，从而产生并不特别严重但是持续时间较长、若隐若现、时有时无的腹痛。但是个别情况下也有一些女性在保守治疗的同时依然还会出现宫外孕破裂性的出血或者流产性的出血，一旦出现较多量的腹腔内出血，则会引发比较严重的疼痛。因此在保守治疗的过程中如果出现比较严重的腹痛，难以耐受，要及时与医生沟通，给予治疗，必要时会由于保守治疗失败或者腹腔内出血而给予止血治疗，否则会引发严重不良结局。