耐药是结核分枝杆菌非常重要的生物学特性，与治疗成败关系密切。 目前认为结核耐药的发病机制主要是由于药物作用的靶点突变导致，耐药的发生原因与不规律用药或单一用药有关。在治疗过程中需遵医嘱，规范用药、联合用药才能够有效减少结核耐药性的发生。 结核耐药的检测主要包含结核菌的培养、药敏检测、分子生物学检测，可以通过实时PCR技术来检测结核相关耐药基因，也可以应用X-Pert快速核酸检测，直接从痰液中检出结核分枝杆菌并判断对利福平是否耐药，其敏感性和特异性优于目前的其它检测方法。