身体发热、头痛的原因如下：1、颅内感染性病变：如脑膜炎、脑炎、脑脓肿、脑内寄生虫病变，都会引起机体发热和头痛症状，还有中枢神经系统症状及意识障碍等症状；2、上呼吸道感染：也会引起感染性头痛，病毒突破血脑屏障后进入脑组织，引起脑细胞水肿，从而出现头痛、头晕、恶心、呕吐等症状；3、肺部疾病：肺部感染及肺结核，也会出现身体发热、头痛的症状；4、耳鼻喉疾病：如鼻窦炎，发作时患者会出现头痛、鼻塞及发烧等症状，建议及时到耳鼻喉科会诊检查；5、泌尿系感染：会反射性引起头痛，同时有机体发热症状，建议到泌尿外科进行会诊治疗。