慢性细菌性前列腺炎抗生素，需选择脂溶性好、易穿透前列腺包膜、血浆蛋白结合低而且偏弱碱性药物。临床推荐药物是磺胺类药物，磺胺类是最容易穿过前列腺包膜的药物，可以在前列腺内形成较高药物浓度。磺胺类药物由于毒副作用比较大，而且抗菌谱比较窄，在临床工作中，很多医生把喹诺酮类的药物作为一线药物进行选择。喹诺酮类的药物包括左氧氟沙星等，可以穿过前列腺包膜，在前列腺局部形成高药浓度，达到抗菌消炎目的。除磺胺类药物和喹诺酮类药物，其他可以穿过前列腺包膜的药物，还包括红霉素、四环素、强力霉素、美满霉素、甲硝唑等药物。新一代大环内酯类药物，在穿过前列腺包膜方面，要优于新一代的喹诺酮类药物，而且相对副作用比较小。在前列腺炎的治疗中，长期应用抗生素治疗以后，可能合并真菌感染或者检查发现真菌感染。因此推荐经验性应用一个阶段的抗真菌药物。