儿童过敏性结膜炎目前常用的药物主要是肥大细胞稳定剂，代表药物是色甘酸钠，在早期因为起作用时间比较慢，可能7天以后才起作用，所以早期用上几天之后没有效果。另外是抗组胺药物，起效时间非常快，但是持续时间比较短，所以产生了第三种药，既有抗组胺，又有肥大细胞稳定效果的作用，代表药物是氮卓斯丁和帕坦洛两种药物。除此之外还有些抗炎的药物，比如激素类的抗炎药和非甾体类的抗炎药，主要是在减轻炎症反应方面起作用。此外在过敏性结膜炎的治疗过程中，可能会用到一些人工泪液，人工泪液的主要作用是能够缓解过敏性结膜炎引起的眼部干涩的症状，同时起到冲洗的作用，能够使眼部表面的过敏原和炎症因子冲洗掉，从而达到一定的治疗和缓解眼痒、眼部充血症状的作用。