导致男孩尿色发红的主要原因如下：一、生理性原因：较为常见，如果进行尿常规检查，发现尿比重、尿胆素升高，通常是由于喝水较少导致的尿色较深。二、血尿：1、泌尿系统结石：这种情况通常伴有疼痛感；2、泌尿道系统损伤：通常具有明确的损伤史；3、肾炎：儿童肾炎较为常见，可能导致血尿发生；4、溶血：可能导致胆素原、尿胆素增高，出现血尿；5、肝胆疾病：出现肝胆疾病时，也可能会出现上述症状；6、感染：如果发现血尿时出现白细胞升高，提示可能存在感染。如果男孩出现尿液发红，可以通过尿常规检查明确尿液成分，还可以进行B超检查，明确是否存在结石等情况，以明确诊断。