房间隔缺损手术后遗症与选择的手术方式直接相关，可以分为如下几种：1、传统的房间隔缺损手术：比较大的房间隔缺损通常采用此种手术，进行修补术时，修补后的后遗症与术前选择的手术时机有关，若患者合并比较重的肺动脉高压，后期会带有一系列由于肺高压导致的后遗症。同时也容易合并心律失常，在做房间隔缺损手术之前就已经有房早、房速甚至房颤，即使做完房间隔缺损修补术，术后还是会有一定程度的心律失常；2、微创手术：随着技术进步，现在很多房间隔缺损选择微创手术如封堵器，这类患者需要有严格适应证，手术相对安全，但也有一些特殊情况，如出现封堵器的脱落，但比较少见。同时比较多见的后遗症可能也是心律失常，有些患者可能有心律方面的变化。选择封堵的患者通常房间隔缺损都不大，因此微创做房间隔缺损进行封堵治疗，术后出现后遗症的几率相对较低。