一边扁桃体疼痛的常见原因如下：1、一侧扁桃体炎：一侧的扁桃体炎就会出现一侧扁桃体疼痛，另一侧扁桃体不疼。此时需要进行消炎治疗，包括口服或者静脉输液抗生素，同时配合漱口液漱口，也可以含服或口服中成药；2、一侧扁桃体出现异物：比如乳头状瘤、角化物或恶性肿瘤等，都可能出现一侧的扁桃体疼痛。不管异物是良性还是恶性，建议尽快将扁桃体切除，两侧的扁桃体都需要切除，切除最好在疼痛缓解之后进行。因此，出现一侧扁桃体疼痛，需要做咽喉镜检查，通过咽喉镜检查，可以明确疼痛一侧的扁桃体表面黏膜有无炎症、渗出物，以及渗出物的性状，比如颜色和黏稠度。除观察黏膜表面，还应检查扁桃体及扁桃体周围是否有新生异物，比如有无突出，若有突出，表面是否光滑，多数情况下是乳头肿瘤或囊肿，如果表面不光滑，性质可能为恶性。