肛瘘不及时治疗大概有以下几个危害：1、症状不能消失：主要症状可能是肛门周围外口有分泌物，局部不舒服，内裤经常会有分泌物粘着，很容易脏；2、局部疼痛：发炎的时候或者感染的时候局部会有疼痛感；3、瘘管会增加：瘘管时间长，可能会出现由单一瘘管向分支瘘管和多个瘘管的发展、迁延，就像树根一样，小树在小的时候树根可能很单一。随着时间的进展，树根会增加，1个树根长成几个树根，瘘管可能也是这样，时间长了之后，1个瘘管可能会变成2个或3个瘘管；4、有恶变的风险：如果时间更长，少部分人会有恶变。由于反复的炎症刺激，会形成癌症的表现，就是皮肤、肛周有鳞癌或者腺癌的表现。虽然发病率很低，但是还是有发病，以前认为肛瘘不会恶变，但是近来的研究表明，个别少数的肛瘘有癌变的风险。