早上起来两个肩膀疼痛，可能和肩周炎、肩袖损伤、椎间盘突出有关，具体如下：1、肩周炎：最常见的原因是肩周炎，肩周炎是因为有时受冷或者各种原因，导致肩膀内多种结构黏连，特别是关节腔黏连，此时会容易产生疼痛。因为睡觉时是平躺状态，肌肉不受力，此时疼痛会稍微减轻，但是早上起来了以后，肩膀受力了，此时就会容易产生疼痛；2、肩袖损伤：肩袖有时拉伤，伤了以后早上起来，肩膀往下荡，肩袖更容易受伤，所以肩袖损伤也是其中可能的原因；3、椎间盘突出：颈椎椎间盘突出，就是晚上睡觉时，脑袋处于休息的状态，所以颈椎上面不受力。早上起来了以后，脑袋的重量就压在颈椎上面，椎间盘往后凸，就压迫后面的脊髓或者神经，此时就容易产生两边肩膀的疼痛。