做无痛胃镜一般没有痛苦，但是可能会有打针、出血等引起的疼痛，但是没有胃镜插管的痛苦。做无痛胃镜麻醉师会提前注射麻醉的药物，帮助睡着。如果是普通的胃镜插管，可能会引起强烈的咽喉部的恶心、呕吐等。但是部分人可能对麻醉药有不良反应，甚至在用完麻醉药苏醒之后，开始出现头晕、恶心等不舒服，有时候很难避免。大部分人在做无痛胃镜的过程中比较舒适，不会出现这种明显的痛苦。