卵巢囊肿需根据患者年龄、对生育的要求、肿瘤的性质等，选择手术方式以及手术途径。良性肿瘤大多行卵巢肿瘤剥离手术，接近围绝经期或绝经以后，可能需要切除患侧卵巢输卵管。 如果是恶性可能要切除双侧卵巢输卵管甚至更大的范围，还需要特殊治疗如放疗和化疗。所以大多数能够通过腹腔镜完成手术，但还要根据病人情况来选择，有些病人需要开腹，少数病人能够通过阴道途径来完成手术。