儿童腺样体手术有可能影响免疫功能，但除腺样体外，还有其它的淋巴组织能够担负同样的免疫功能，比如扁桃体。另外在咽喉部有其他的淋巴组织如咽后壁的淋巴滤泡，咽鼓管周围也有散在的淋巴组织，都有担负免疫功能的作用。切除腺样体后，儿童在短期内有可能出现免疫力下降的问题。但一般正常情况下，1个月左右免疫力都能得到很好的恢复。如果出现腺样体肥大的问题，进行腺样体切除手术比较安全。虽然在短期之内有可能出现免疫力下降，但整体儿童不会造成比较大的困扰和损伤。