双肾结石、双肾囊肿、肌酐升高，存在慢性肾功能不全，是否需要治疗结石和囊肿，需要结合具体情况判断，具体如下：1、不需要：如果结石比较小，比如＜5mm，或者1cm左右，并不引起肾脏的梗阻、积水，即结石不是影响肾功能的原因，同时肾囊肿为良性，位置上也没有引起肾脏的积水，这种情况下，就不需要进行积极治疗。因为进行碎石、取石的手术，或者肾囊肿的手术，均有可能进一步地加重肾功能的损害，或者手术本身也会有一定的创伤和风险；2、需要：如果是结石产生肾脏梗阻，造成肾脏的积水，或者囊肿的位置，长在肾盂旁，正好压迫肾盂，影响尿液排出。这种情况下，肾结石或肾囊肿，都有可能加重肾功能的损害。这时进行肾结石或肾囊肿的手术，有可能会对肾功能的改善有一定的帮助，可以在充分评估的基础上考虑手术治疗。