无痛肠镜的危险性较低，是患者在麻醉后，比较舒服的状态下完成，相对比较安全。但无痛肠镜检查属于有创操作，可能要承担检查本身的风险，及麻醉的风险，具体如下：1、检查风险：一般检查风险较低，但对于做过腹部手术，腹部存在粘连或患有肿瘤的患者，可能会牵扯到解剖结构的异常。在做检查时，可能会发生出血、穿孔等风险；2、麻醉风险：需要经过专业的麻醉医生进行全面评估，在做无痛肠镜时，通常应用静脉麻醉，虽然相对较安全，但对于呼吸、心脏仍会存在一定影响。在整个实施的过程中，会由麻醉医生和消化内镜医生共同完成无痛肠镜，因此属于比较安全的检查。