部分患者的心脏神经官能症可以自愈。心脏神经官能症是功能性疾病，与情绪有密切关系，它通常有一定的诱因，部分患者甚至合并更年期综合征或者焦虑、抑郁等情绪，如出现不顺心或者烦心的事情，会诱发心脏神经官能的出现。如果此类事件过去以后，患者的心情会逐渐平复，情绪不再紧张或激动，症状也会逐渐地缓解。另外，部分患者有更年期综合征，会伴有心脏神经官能症，随着逐渐地适应体内较低的雌激素水平，心脏的症状会缓解或者消失。但是有些焦虑或者抑郁的患者，通过治疗后，甚至睡眠改善以后，焦虑、抑郁的情绪可以得到缓解，心脏的不适症状也会缓解，部分患者可能甚至不需要进行心脏方面的药物治疗，则可以自愈。