男生在排完小便以后出现尿道明显的刺痛，有三个最常见的原因：1、尿道炎症：各种原因导致的尿道炎症是最常见的原因，如淋菌性的尿道炎、非淋菌性的尿道炎，都会导致患者排尿时出现尿道的灼热、刺痛。根据患者感染的病原体不同，尿道可能会出现黄色的脓性分泌物、稀薄的、少量的浆液性的分泌物，或者透明的分泌物，甚至没有明显的分泌物存在；2、结石：包括尿道结石、膀胱结石、输尿管的结石等等，输尿管末端结石、膀胱结石以及尿道结石，都会引起男性在排尿的时候出现尿道的刺痛症状，这是由于结石刺激，引起的反射性或者叫放射性的疼痛症状，往往还有伴有隐隐的尿血症状；3、前列腺炎：男性患者在出现前列腺炎的时候，有时候也会在排尿初，尤其是排尿终末的时候，出现尿道的刺痛症状。