右侧输卵管疼痛的原因主要如下：一、输卵管疼痛：1、病原体感染：如支原体、衣原体等感染；2、输卵管脓肿、积脓：疼痛程度较剧烈，甚至伴有血象增高等表现，可能需要通过手术治疗才能得以缓解；3、输卵管痉挛：临床上较为常见，主要由于进行造影和通液检查时，刺激输卵管平滑肌引起痉挛所致。二、卵巢疼痛：如产生囊肿和扭转等情况，可能引起比较剧烈的疼痛。