卵巢囊肿的原因如下： 1、生理性囊肿：就是在排卵过程中可能残存卵泡没有排出，或者卵泡排出以后形成的黄体囊肿没有消失，则在超声下可观察到卵巢囊肿，但此类囊肿通常都比较小，大约是2-3cm，如果在此次月经周期中，检查到卵巢有囊肿，而月经干净后，在下一个月经周期复查，发现囊肿消失，单纯的左侧有囊肿或右侧有囊肿，通常是生理性囊肿，可以不处理； 2、病理性囊肿：若反复检查囊肿持续存在，持续3个月以上，则通常是病理性囊肿，包括单纯性囊肿、畸胎瘤、巧克力囊肿等，如果是病理性囊肿，则应到医院检查，囊肿大于5cm时，需要考虑手术处理。