怀孕5个月肚子隐隐作痛，主要包含以下几种原因：1、宫缩：孕妇劳累或胚胎自身因素存在先兆流产，孕妇肚子发生隐隐作痛是因微弱宫缩引起，孕妇需积极就诊于妇产科咨询产科医生，综合评判隐隐作痛是否因宫缩引起；2、胃肠道痉挛：怀孕5个月孕妇，早孕反应已消失，此时孕妇食欲大开，进食过程中可能由于不良的进食习惯或进食不洁食物，引起胃肠道不适，发生胃肠道痉挛、肚子出现隐隐作痛、甚至腹泻、腹胀等，可在消化内科医生的检查下确诊；3、泌尿系统感染：孕5个月的孕妇泌尿系统由于受压或者长期憋尿，导致细菌逆行感染，表现小腹隐隐作痛，特别是小便后发生尿频、尿急、尿痛等泌尿道刺激症状，可诊断尿路感染。妇产科医生和内外科医生综合诊断尽快确诊，通过尿常规检测区分其他方面疼痛，如阑尾炎的疼痛、输尿管结石、异常的卵巢囊肿扭转等；4、其他：怀孕五个月肚子疼痛较轻，经过休息可好转，可能由于子宫不断增大，韧带和周围组织的牵拉作用引起较轻的隐隐作痛，可继续观察。