患儿室间隔缺损手术有疼痛感，不同室间隔缺损与不同手术方式，对患儿影响不同。如果缺损在膜部，较小的室间隔缺损可选择微创治疗，可使用内科介入封堵治疗，对肌肉组织牵拉较少，疼痛感较小，甚至无疼痛。 少部分室间隔缺损无法通过微创治疗，仅可通过开刀手术治疗，需要体外循环，分为正中切口以及右侧切口，正中切口损伤较大，术后疼痛感较强。体外循环下进行室间隔缺损修补术，需放置常规引流管，引流管引起的术后疼痛感较重。因此室间隔缺损手术会出现疼痛感，但如果选择微创手术，患儿疼痛感较轻。