目前研究归纳总结及临床医生发现，扁桃体与腺样体切除术后没有明确不良后遗症。因扁桃体与腺样体只是咽部淋巴环的一部分，所以当有手术指征时，如腺样体肥大程度较重，导致儿童夜间睡觉打鼾、张口呼吸甚至睡眠不安，此时会影响儿童生长发育，需手术切除腺样体。若扁桃体肥大造成气道阻塞、睡眠打鼾，也需要切除。此外，若是扁桃体慢性炎症反复发作，如一年发作4-5次，也应进行扁桃体切除术。手术利弊需权衡考虑，通常医生会综合判断气道阻塞程度、炎症反复发作程度，甚至考虑对中耳及听力影响，判断患者是否应进行手术治疗。