左侧腋窝下隐隐作痛的原因如下：1、皮脂腺囊肿：左侧腋窝有皮脂腺囊肿，是常见疾病，通常是毛囊阻塞所致。患者可以去医院普外科或皮肤科进行明确，如果为该疾病，需要尽早行手术切除，以防止出现红肿和破溃；2、脂肪瘤：当脂肪颗粒在局部异常汇聚，增大并增多时，就会引起局部出现明显疼痛，需查彩超或CT等进行明确；3、淋巴结肿大：淋巴结是身体免疫器官的一部分，有许多的淋巴细胞和免疫细胞。当细胞增大、增多时，就会引起淋巴结肿大和疼痛，需要完善相关检查才能够明确病因，如血常规、C反应蛋白、彩超等。有时还需要做淋巴结的穿刺活检，或切除活检以明确性质，根据检查结果给予相应的治疗。