奥硝唑氯化钠与奥硝唑片、替硝唑片及甲硝唑属于治疗厌氧菌感染药物，作用范围较窄，需要选择合适适应症使用。腹腔感染、胃肠道感染及口腔感染属于厌氧菌感染可能性较大，采用奥硝唑氯化钠治疗。临床上用作术前和术后，预防腹腔感染，尤其是腹腔手术。口腔操作后使用奥硝唑预防牙周炎、口腔炎以及口腔厌氧菌感染。皮肤外伤时，如蜂窝织炎、气性坏疽，奥硝唑氯化钠用于治疗和预防气性坏疽以及蜂窝织炎。临床上一种幽门螺旋杆菌，采用阿莫西林、克拉霉素联合使用，治疗幽门螺旋杆菌感染，奥硝唑氯化钠1天1次即可。