纤支镜取活检的主要目的是为了明确结核、肿瘤等疾病的诊断，从而指导治疗方法的选择。一般在取活检前，医生要找到病灶部位，然后再采用相应检查方法，如刷检、钳夹活检、穿刺针吸活检，这些所有的检查都是在直视下进行的，而且随着技术的发展，还可以采用另外一些先进的技术，像镜下超声、导航系统引导，可以精确到达病灶部位，采用一种或多种方法，最终取得满意的、最有可能确诊的细胞学或组织学、病理学标本，以帮助疾病的诊断。