卵巢巧克力囊肿破裂，在临床上治疗最好的方法是手术治疗。囊肿一旦破裂病人会表现为急性下腹部疼痛，并且会出现恶心、呕吐、肛门下坠感，严重的出血多可能会导致病人失血性休克。在手术过程中，一定彻底清理盆腔，尽量减少巧克力囊肿溢出的组织，在盆腔内种植在其他脏器上。并且在手术后要进行后续治疗，比如用唯散宁(地诺孕素片)进行治疗；另外，也可注射醋酸曲普瑞林。后续治疗主要是抑制卵巢巧克力囊肿复发的可能性。因为巧克力囊肿一旦破裂，其碎片将在盆腔、腹腔内种植，所以术后后续治疗非常重要。此外，建议手术后，病人在饮食上不要吃含有雌性激素的食物，以减少卵巢巧克力囊肿复发的可能性。术后还需要定期做妇科检查、B超检查，了解卵巢巧克力囊肿是否有复发的可能性。