三个月宝宝眼睛有红血丝，是眼睛结膜发炎导致，最常见的原因是细菌、病毒以及外伤等导致的结膜充血、红肿。三个月的宝宝接触不卫生的物品或者是脏手揉眼睛，容易导致眼部的结膜充血，出现结膜炎。致病微生物可能是细菌、病毒或者其他致病微生物，有以下三种情况：1、细菌性感染：如果带有红肿以及黏稠的分泌物，最常见的原因是细菌性感染；2、病毒性感染：如果伴有大量流泪或比较稀的眼泪，可能是病毒性感染；3、过敏：如果揉眼、眼睛痒，出现拉丝样分泌物，过敏的原因更加常见。所以，三个月的宝宝眼睛出现红血丝，可能是不同的原因造成，需要进行相应鉴别和不同的治疗。