腔镜手术的术后并发症和开放手术基本上类同，最常见的有喉返神经损伤，导致病人声音嘶哑，甲状旁腺损伤出现旁腺功能障碍，表现出病人手麻木、抽搐，更严重的怕出现术后出血，因为腔镜病人，创面相对更大，出血概率可能要比开放手术更高。只要出血是非常严重的并发症，甲状腺手术在气管周围一旦出血，甚至没有及时发现，会危及病人生命，会导致病人窒息甚至死亡的问题。相对于开放手术来说，可能会有皮肤明显烫伤，引起皮肤烧伤，甚至有的病人需要植皮，这是它不同于开放的手术的并发症。 有病人会出现皮下气肿。一般皮下气肿大多数过上一段时间就会吸收，对病人没有太大影响，大多数原因是由于手术时间过长而造成，腔镜手术和开放手术相比没有明显增多的并发症发生，是相对安全的手术方式。