男性小肚子疼的原因，一般依据疼痛的部位不同原因也会有所区别，具体如下：1、急性阑尾炎：阑尾位于人体的右下腹，如果阑尾伴有化脓性感染会引起右下腹疼痛，右下腹出现压痛、反跳痛。可以通过彩超检查或者CT扫描，来评估阑尾的感染严重程度。严重感染时，患者会出现发热、恶心、呕吐、腹泻等表现。阑尾炎一旦确诊，尽早行手术治疗切除阑尾可以取得比较好的治疗效果；2、泌尿系感染：如果患者小肚子的正下方疼，很有可能是膀胱或前列腺的炎症，会出现尿急、尿频、尿痛等表现。可以通过泌尿系的彩超以及尿常规、尿培养检查，明确泌尿系感染的严重程度。通过积极的输注抗生素和口服药物，可以有效减轻泌尿系感染造成的小肚子疼；3、胃肠道疾病：如果患者的小肚子左侧疼，要考虑到结肠或小肠的炎症。部分患者由于饮食后剧烈运动，造成肠扭转或者肠道梗阻也会出现疼痛症状，通过腹部CT检查可以明确疼痛的具体原因。