胆管结石在初期通常并没有明显的症状，或者胆管结石的初期症状通常比较轻微，严重后因为阻塞胆道，可能会诱发疼痛、肝功异常以及胆道炎症的问题。胆管结石包括肝外胆管及肝内胆管结石，尤其是肝内胆管结石，一般只有通过超声才能发现存在于沿着胆管分布的高回声结构，这些结石只要不阻塞胆管，患者就不会有明显的不适，很多患者甚至连肝功能异常都不存在。而肝外胆管结石，在刚发生时由于没有阻塞胆管，同样也不会有明显症状。但是当肝外胆管结石或肝内胆管结石阻塞胆管后，患者可能会出现不同程度的肝功能异常，主要表现为以转肽酶、碱性磷酸酶为主的反应胆道通畅性的酶学异常，严重者可以出现胆红素和转氨酶的异常升高。当梗阻比较严重后，患者可能会出现显著的上腹部绞痛，继发细菌感染可能会出现发热等全身的炎症反应表现。