治疗灰指甲的药物对身体是有害的，是药三分毒，不管是外用药物还是口服药物，对身体都有一些不良的影响。1、外用药物相对来说它的副作用小一些，它的副作用大部分就是局部的副作用，对于灰指甲的外用药物，它除了对指甲有抗真菌作用之外，对周围的皮肤可能有刺激的反应，所以要规范地去使用，并且注意一些注意事项。2、对有一些口服的抗真菌的药物，它相对来说副作用大一些，药物多多少少都有一些副作用，特别是抗真菌的药物，对肝功都多少有一点影响。所以肝功不正常的一定要注意禁用，或者是要在医生的指导下去使用，并且在治疗以后要定期检查肝功，以防止药物的一些副作用发生。