杀完幽门螺杆菌后，大多数患者可能还需要吃1-2周促进黏膜修复的药物。大多数患者感染幽门螺杆菌后，会引起胃炎，部分人的胃炎程度比较轻，主要是浅表性胃炎，即胃黏膜有充血、水肿，部分患者炎症比较重，除充血水肿外，可能还会有黏膜糜烂，甚至溃疡。如果只是在杀灭幽门螺杆菌后，将致病因素去除，造成的炎症可能没有完全恢复，继续服用1-2周促进黏膜修复的药物，对胃炎的康复有好处。除停用抗菌素外，质子泵抑制剂可以继续应用1-2周，同时可以加用黏膜保护剂，如铝碳酸镁、硫糖铝、替普瑞酮、索法酮等治胃的药物。如果还有胃胀、打嗝、消化不良等症状，可以同时应用吗丁啉、胃复安，以及可以补充消化酶的药物，如米曲菌胰酶等药物。当上述症状恢复后，可以暂停药物的使用，在停用幽门螺杆菌的药物4周后，再进行幽门螺杆菌的检测，可以选用呼气试验，根据其结果判断是否达到彻底根除。