在临床中部分尖锐湿疣患者在治疗后比较容易复发，对于抽烟、喝酒以及治疗期间仍有性行为，均容易导致尖锐湿疣高发。 此外，机体免疫状态对于尖锐湿疣的复发也具有重要的作用，由于感染尖锐湿疣而导致心理压力非常大，甚至夜间失眠，出现焦虑症状，机体的免疫状态下降也会导致尖锐湿疣的复发。 尖锐湿疣感染的过程中除肉眼可以看到的疣体，还存在亚临床感染状态和潜伏感染状态，亚临床感染状态是指有感染病毒，且有细胞学改变，而潜伏感染是指感染病毒，两种状态的持续存在都会加重尖锐湿疣复发。