胚胎移植手术需要的时间较短，从正式开始操作所需要的时间，大约是几分钟。大多数人感觉时间比较长，是由于进入胚胎移植室后，准备的时间比较长。首先进行消毒，然后取膀胱截石位，在B超下看清子宫，然后对宫颈进行消毒，等临床的医生准备完后，充分地暴露宫颈，将移植的外套管放进子宫腔内，然后等待实验室的工作人员，将胚胎吸到移植管的内管中。吸到内管中，实验室的工作人员会拿着含有胚胎的移植管跟临床医生配合，将内管通过外套管进入到子宫腔内，然后在B超的引导下，慢慢把含有胚胎的液体注射到子宫腔内。整个操作过程，从内管进入到宫腔到拔出来，也就2min左右。有些时间比较长，是因为进管通过宫颈内口时相对比较困难，所以需要的时间长一些。绝大多数女性，只要憋尿比较充足，子宫的位置正常，没有前倾或者后屈，一般都是几分钟就可以完成胚胎的移植。